在少年支仓孝平(小野大辅 配音)的记忆中,自己好像一直都在转学中,这样的遭遇使得孝平很难拥有一段长久且稳定的友谊。这一次,孝平转入了修智馆学院,这所全日制的寄宿学校为孝平晦暗的心情带来了新的希望,孝平决定,一定要在这所学校里交到要好的朋友。
所谓S•A班就是special A班,尖子班中的尖子班,只有全年级前七名的精英学生才能进入S•A班。但是光在这里依然打不败全年级第一的彗,还被彗戏谑地称作永远的第二名。除了彗和光,S•A班里还有第三名、第四名的天才音乐家的孩子山本纯(代永翼 配音)和山本芽(高垣彩阳 配音)双胞胎兄妹;第五名的学院理事长的儿子狩野宙(下野紘 配音);第六名的航空公司社长千金东堂明(生天目仁美 配音);第七名的体育用品公司社长的儿子辻龙(堀江一真 配音)。光一次次挑战彗的故事还在继续……