光雄（北岛俊辅饰演）决心成为一名拳击手，并将所有的精力和时间都投入到这项事业中，希望有一天能赢得世界冠军的荣耀。有一天，光雄的哥哥（河野康志饰演）委托他照顾两只小猫，一只叫小黑，另一只叫小吉。
祖先传下来的民间文学作家Ise Masahiro（Sakaiya饰演）嫁给了他崇拜的年轻编辑Akiko（Takahata Chongxi饰演）。他们是新婚夫妇，关系密切。他们一起回到了伊势的出生地镰仓。
在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
