21世纪初,人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上,仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆,前往能够移居的“约定之地·τ星e”。但这一计划失败,人类只得再度返回地球。魔术师赫鲁卡蔑视各个地区没有骨气的国王,而流浪骑士西奥则为了解放饱受暴政折磨的家乡而练习武术。在星奏学院里,学生被分为两类,一类是就读于普通科的平凡学生,另一类是就读于音乐科的能够看见音乐精灵的演奏天才。在一次偶然中,普通科的日野香穗子(高木礼子 配音)撞见了音乐精灵莉莉(水桥香织 配音)。