为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!
在他自己的努力和王后梅洛玛的帮助下,尚文恢复了自己的声誉,获得了自己的领土,并为即将到来的浪潮做好了准备。然而,在梅洛马格以东的乌龟王国,可能带来前所未有灾难的恶魔——乌龟——已经复活。尚文接受了女王的委托镇压灵龟,团队将他们新加入的队友莱西娅带到了灵龟之国。随着联军的逐渐集结,乌龟王国国王的侧室——摄政公主奥斯特·蓬莱出现在尚文面前。尚文从她那里得知,灵龟是由人类以一种非传统的方式复活的。他们真的能压制住灵龟并揭露幕后主谋吗?