富士山下的小村庄正在进行热闹的祭典，突如其来的山火却让人们陷入恐慌之中，而天文学家白石良一（平田昭彦 饰）则在混乱中失踪。不久，当地发生滑坡、天坑等离奇事件，更有一个巨大、恐怖的机器人出现，对周遭城镇进行大肆破坏。
故事发生在大阪的舞户学园，小泉理沙（冈村明美 配音）是一个身高170的“女巨人”，经常因为身高而被嘲笑的她在潜移默化之中担负起了搞笑的重任。无巧不成书，和理沙相对应的，同校的大谷敦士（永田彬 配音）是一个个头只有156的“矮冬瓜”，这一高一矮的两人不是冤家不聚头，在一 唱一和中，居然称为了校园之中的著名搞笑组合。 其实理沙和大谷之间的感情并不坏，两人甚至还有着共同的爱好——均是“海坊主”的粉丝。在出双入对的同时，他们的距离也越来越近，在好友石原信子（东纱织 配音）和中尾平吉（津田健次郎 配音）的撮合下，终成眷属，一段校园爱情佳话成为传奇。
