世纪王·黑日必须和世纪王·影月进行赌上性命的战斗，胜者就可以成为新一任的世纪王。但是被改造成为黑日的光太郎在秋月总一郎的帮助下，成功在脑改造手术前逃脱出来。此后光太郎成为假面骑士Black，为了保护日本，救出信彦而与戈鲁戈姆对抗。但是信彦却在被救出之前就变成世纪王·影月，于是光太郎不得不与他唯一的亲友信彦进行宿命的战斗。
于是，齐木南雄封存了自己的超能力，全身心地投入到成为一个默默无闻的普通人中。然而，南雄七似乎发出的无线电波吸引了陌生的人。愚蠢顽皮的年轻人鸣人（小野大辅配音）、身患绝症的隼顺（岛崎信长配音）、无所畏惧的精神力量人物西本（花江夏树配音），从头到脚，完美的高桥真奈美（矢野爱一配音）从内到外闪耀，一次又一次地陷入困境。
从被吞噬中逃生的天空之树被竖立起来了。人们在奇怪的景象前假装——还有一些东西从黑点内部靠近。在无法到达的绝望中，人们从被称为“敌人x的数不胜数”的黑点来到宙斯。
