在绝望的边缘，她从父亲那里收到了一个吊坠，唤醒了她内心深处的神秘力量。这个世界上有比死亡更可怕的事情，在这个监狱里发生的事情绝对是其中之一。“出现在徐伦面前的神秘男孩向她传达了这一信息，莫名其妙的事情接二连三地发生。当她的父亲来到监狱时，他告诉了她这个可怕的真相，以及“迪奥”这个名字“…许伦最终能走出这片被称为监狱的石海吗？最后的决战已经开始，乔斯达家族和迪奥之间长达一个世纪的命运决战即将结束！！
然而，医生仍然无法接受失去孩子的痛苦，也无法正确治疗阿童木，因为他认为阿童木不是人而抛弃了他。阿童木成了一个无家可归的流浪者，也被各地的军队通缉，最终被抓获。军方要求天马博士去除阿童木的能量，并将其转化为军用机器人的能源。在最后一刻，天马医生突然醒来，协助阿童木逃跑。面对军方的追击和拦截，阿童木奋起反抗，最终，一场惊天动地的战争迫在眉睫。在不断旅行的过程中，阿童木逐渐长大，他也接受了自己将机械与人类结合的设计，肩负起了全人类生存的责任。
高川美宇突然收到一封信。信中说她已被选为新项目的成员。她半信半疑地走到信上写的地址，那里有七个像她一样被召唤的年轻女孩。一个巨大的秘密设施引起了他们的注意。
