幕府末年的海阪藩,下级武士清兵卫(真田广之)在妻子病逝后,以微薄薪俸独自照料痴呆老母和两个年幼女儿,由于每日结束工作后都是匆匆回家从不参加应酬,他被同僚们戏称为“黄昏的清兵卫”。
故事舞台在21世纪中期的东京,那时东京已经因为温暖化而被密林所覆盖,被骤雨与恐怖的热带蚊所威胁的人们建起了以希腊巨神阿特拉斯命名的高塔移迁到了空中。但是并不是所有的人类都拥有这样的福利,贫困的人们仍然得留在地面与种种危机为邻过着艰辛的生活。
他们一直待在家里,没有去上学。当他的母亲去百货公司工作时,还很小的明代替母亲在家履行父母的责任。突然有一天,她的母亲不见了,只留下20万日元现金和一张短纸条给孩子们。在把她的兄弟姐妹交给明照顾后,她悄悄地离开了家。对于四个没有亲属或不了解外界的孩子来说,开始面对新生活并不是一件容易的事