2019年的一个夜晚,新东京郊外的封闭高速公路上,暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年,是一名叫做金 田的职业高中学生。 突然,街上出现了一位奇怪的矮个子男子,暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时,军队驾驶直升飞机赶到。将那位矮个男子与铁雄一起收押。 铁雄进入了一个陌生的地方,这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道,他们的未来,因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。
1989年,日本。乔纳森·乔斯达和迪欧决战一百年后,迪欧复活了。与此同时,约瑟夫的孙子近条太郎发现他有替身的能力,而迪欧的复活影响了对替身没有抵抗力的母亲,并陷入了危急状态;为了救他垂死的母亲,成太郎和约瑟夫出发前往DIO所在地——埃及。
小男孩在爬上一个电缆高路标塔时触电。他长大后,发现自己在暴怒时会有零星的电从拳头中飞闪出来。在东京的别处,也有一个电子奇才,他碰巧是个嗜好电子武器的义务警员。