原来后来者便是见崎鸣（高森奈津美 配音），恶作剧的女孩则是她自幼便分离的双胞胎姐妹未咲（五十岚裕美 配音）。性格不同的两姐妹结伴游玩，讲述着关于身世、血缘最真实的感受。令见崎担忧的是，她的左眼隐隐看到即将发生在未咲身上的不祥征兆，次日去游乐场的路上，她无论如何希望守护未咲。姐妹俩快乐而短暂的一天…… 本片根据綾辻行人的同名原作改编。
在那次事故之后，我妻由乃（村田知沙 配音）恢复了平常的生活。炎炎夏日，她所在的学校组织了海滨夏令营，在碧海蓝天之下，由乃和日野日向（松冈由贵 配音）、野野坂真央（由加奈 配音）、高坂王子（白石稔 配音）等好友快乐玩耍，享受着青春瞬间。
Oki医生（石冢云生配音）看到了这种情况，把一只非常顽皮的皮卡丘送给了这个迷路的年轻人，皮卡丘拒绝为精灵球得分。于是，他们两人踏上了精灵宝可梦的旅程。在旅途中，他们的隔阂逐渐破裂，他们遇到了同伴成子（佐藤杂志配音）和宗慈（Hon Koji配音），并听说了凤凰王的传说。在彩虹羽毛的指引下，任何遇到凤凰王的人都将成为彩虹战士。。。“这部剧场版是《精灵宝可梦》动画系列的第20部电影。这部电影的情节改编自动画系列的第一集《精灵宝宝可梦！这取决于你！”，描绘了高知和皮卡丘开始冒险成为神奇宝贝大师的故事。
