故事发生在二十一世纪初年，一场浩大的灾难让“生府”取代了原有政府，成为了国家最高领导组织。经过死亡的洗礼，人们开始格外重视生命的重要性，于是，政务在居民们体内植入了“WatchMe”设备，以检测和介入他们的健康状况，这也就意味着，身体不再是属于个人的所有物，而是被列入了国家管理的范畴，自杀更是无可饶恕的重罪。 雾慧图安（泽城美雪 配音）、御冷弥迦（上田丽奈 配音）和零下堂吉安（洲崎绫 配音）是三位对现存制度产生了疑虑的少女，在弥迦的带领下，她们准备自杀以挑战制度，可是最终弥迦死了，计划失败。一晃眼多年过去，雾慧和吉安重逢，与此同时，全国各地发生了数千起集体自杀的案件，而这背后的真相和弥迦当年的死有着千丝万缕的关联。
一切都源于被国家指控制造难民杀戮的前第78联合部队指挥官曾沃在（也由泽木宇配音）及其下属坚信这一切是国家阴谋。我曾经不愿意被污染，所以我试图通过互联网揭露大国的不法行为。在调查过程中，铃木逐渐了解到了真相，她也朝着组建自己的部队迈出了重要一步。。。这部电影是《攻壳机动队》前传《ARISE》的第二部。
