27岁的上班族河地大吉(松山健一 饰)赶回家乡参加外公的葬礼,意外见到了外公的私生女——美丽而可怜的鹿贺凛(芦田爱菜 饰)。凛自然无法得到鹿贺家族的认可,却引起了大吉的关注与同情。最终,大吉将这个年仅6岁、尚在尿床的小阿姨带回东京独自抚养。故事发生在1999年,那个不详的世纪之末。坐落在深山之中,由于不断的发生灵异事件而被称为“超自然学院”的私立学校里,迎来了它年轻强势的新一任校长——神代玛雅(日笠阳子 配音)。