所有的动植物都有哥斯拉细胞，成为“怪物星球”的地球。这里的国王是历史上最大的哥斯拉“哥斯拉地球”，高度超过300米。英雄庆南点燃了对哥斯拉的讨伐，他遇到了人类福图亚的后代。在Futuya的双胞胎姐妹Maina和Miana的指导下，庆南等人发现了哥斯拉的决定性武器——机械哥斯拉——的遗骸，该武器仍在扩散。他们使用构成残骸的纳米金属发射了武装堡垒城市的“机械哥斯拉城”，并挑战了“哥斯拉地球”。在这场战斗中，之前共存的外星种族之一比尔沙尔德和人类之间的裂痕逐渐显现。与比尔沙尔德领导人加尔格“如果你想推翻哥斯拉，你必须超越‘人’的存在”的信念相反，阳光人不能放弃“你不能为了推翻怪物而把自己变成怪物，你应该作为‘人’来打败它”的信念。最后，庆南放弃了击败“哥斯拉地球”的唯一机会，杀死了加尔格。另一方面，Haruna的青梅竹马Yoko也因Bilshard对人体进行的强制纳米化而陷入脑死亡状态。失败感和虚无感在人类中蔓延。另一方面，外星人，宗教种族Echever的大主教Metphis，主张哈鲁纳从战斗中幸存下来是一个“奇迹”，并因此增加了他的追随者。这是为了实现埃克塞特隐藏的“终极目标”。米安娜和美娜对这样的埃克斯维尔保持警惕。此外，庆南还问自己，作为一个“人”，应该做什么。很快，在无人能敌“哥斯拉地球”的地球上，覆盖着金色闪光的“基多拉”降临，惊天动地的超次元大战开始了。什么是“哥斯拉”？一个人应该做什么？庆南眼中的未来是。在最后一章中，一切都会明朗起来。
该作品改编自Teriyama的同名原作，时间线设定在不久的将来的2021年，但仍然聚焦于年轻人的困惑和焦虑。
「为了拯救世界，我们还有必须要做的事情！」 加布兽的话给大和带来了活力，而亚古兽则坚信太一定会回来。 另一方面，恒常性要处置失去控制的秩序兽、 并尝试施行干涉现实世界的最终计划。 为了阻止毁灭的到来，被选召的孩子们和他们的搭档拼命地战斗。 「所有的光芒，都汇聚在了缅因猫兽…」 绝望的迪路兽向大家说到。 孩子们做出最后决定的时候到了。 被选中的孩子们，自己将选择怎样的未来？ 现在，冒险将再一次进化。
