长大后偶然重逢的青梅竹马相马悠依(井上真央 饰)和鸟野直木(佐藤健 饰),再次确信对方是自己命中注定的对象,但就在他们下定决心要向对方求婚的时候,直木却被卷入一桩不可思议的事件中,消失了踪影。直木不知道自己死了,变成灵魂在现世徘徊。
有一天,由于一种名为“野兽”的生物的入侵,人类平静的生活结束了。当最后一个人类威廉(由新井良宏配音)从沉睡中醒来时,他发现500年过去了,威廉承载着人类延续的最后希望。在这个世界上,只有知道如何使用圣剑的怪物才能与野兽竞争。
灾难性袭击对世界造成“第二次冲击”后,世界在废墟上重建。14岁的Ikashi Shinji被他的父亲Ikashi Moto召集到第三新东京城。我以为我能看到他受到父亲的欢迎,但我看到一个名叫“使徒”的巨大生物与军队交火。