原来这个人就是前海军上将Z（大冢芳中配音），他培养了无数优秀的门徒。醒来后，Z发现了路飞（田中真子配音）等人的身份，于是反目成仇。他们与下属Ai（由真原良子配音）和Binz（由川川明配音）一起，残忍无情地对草帽海盗队造成了沉重的伤害。本来，Z因为某件往事对海盗深恶痛绝，而此时，他正在酝酿一个恐怖计划，即将带领“近地天体海军”一举消灭新世界的海盗。他的行为引起了海军总部的恐惧，而被击败的路飞等人也将对这个前所未有的敌人发起新的挑战。。。这部电影是改编自同名动漫的剧场版，由原作者小田荣一郎担任制作总监，艾薇儿·拉维尼演唱主题曲《How You Remind Me》和《Bad Reputation》。
故事发生在风景如画宁静祥和的镰仓，橘一夏（本多阳子 配音）是出生和生活在这里的平凡中学二年级女孩。性格温文尔雅跟所有人都能成为朋友的篁萤子（落合祐里香 配音）、性格活泼开朗元气满满运动神经十分发达的多岐川皋月（川上伦子 配音）和身世非常神秘常常展现出超越了年龄的成熟与知性的宗方未知留（田村由香里 配音），这三名性格迥异的女孩是橘一夏的好友，四人之间感情十分要好。 在学期的最后一天，一夏离开学校之后发现自己十分珍爱的护身符丢在了教室，于是返回了学校，在那里，一夏邂逅了名为黑城舞夏（浅野真澄 配音）的少女。命运的齿轮开始了转动。
2017年，E.U.联军132部队向圣彼得堡挺进，但遭到帝国军队的围困，面临全军覆没的危险。联军少校蕾拉·玛露卡尔（坂本真绫 配音）将旧日本青年组成非正规军W Zero部队，并提出以这支部队营救132部队的建议。但是在最为凶险的前线，他们不过肩负着牺牲自己来营救友军的悲哀命运。惨烈的对决过后，W Zero部队的中尉日向瑛斗（入野自由 配音）成功完成任务。 而战争还远远未曾结束，新的阴谋与危机浮出水面……
