由于一场车祸,痴迷数学的博士(由寺井隆饰演)患上了奇怪的健忘症。从那时起,他只能保留80分钟的记忆。80分钟后,一切和人都像一个新的开始,所以他必须总是在身上贴上笔记,提醒自己一些重要的事情。当时,这位医生在哥哥的支持下去了英国学习。
游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台,玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角,在追查神秘连续杀人事件时,潜在的“PERSONA”能力觉醒,同时也开启了进入异世界的大门,与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化,结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程;战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫,发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。