一个名叫克鲁贝洛斯（由久川雅雅配音）的会说话的玩偶出现在她面前。小可告诉她，他是守护这本书的神兽，书中封印着一种名为库洛牌的东西。现在封印解除了，它希望小樱成为一名库罗法师，并将帮助她恢复这些制造麻烦的库罗牌。第二天，一个叫李晓朗（由熊井素子配音）的转学生被调到了樱花的班。这个看起来很酷的男孩也是冲着库罗牌来的。随着库罗牌的封印，越来越多的角色出现在小樱身边，但他们的真实目的仍然未知。
街にはこのグループに対抗して中年いざこざを起こす“西部会”があり、主導権を争っていた。ある日、白馬にのった美女がタキたちの前に現れた。各地に数十万の信者をもつ正教学会の幹部・藤森信介の2号のアサ子(范文雀)で、タキに近づいたのは何か魂胆があってのことだった。そんな頃グループの一人であるデボは毎夜のごとく、高校の校庭を掘り起こしていた。この校庭には以前、戦争で使用した軽機関銃と拳銃がどこかに埋められているとのことだった。グループの皆からバカにされながらも掘り続けていたのだが・・・。
游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台，玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角，在追查神秘连续杀人事件时，潜在的“PERSONA”能力觉醒，同时也开启了进入异世界的大门，与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化，结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程；战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫，发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。
