三年前的一场交通事故令凉宫遥(栗林美奈实 配音)陷入了昏迷之中,鸣海孝之(谷山纪章 配音)一直将交通事故的责任归结在自己的身上,因此陷入了痛苦和颓废之中,在此期间,爱慕着孝之的速濑水月(高桥智秋 配音)不离不弃的照顾和鼓励着孝之,两人不知不觉之中就开始了宛如情侣一般的半同居生活。 某一日,凉宫遥突然从昏迷中苏醒了,因为脑部受伤,所以她的记忆暂时出现了混乱。孝之将此当做是赎罪的契机,于是一直守护着凉宫遥,水月将这一切都看在眼里,她直到,孝之真正喜欢的只有凉宫遥一个人,黯然之中,她选择了默默退出。
这四人本应一起睡在毯子下,与其他物体依偎在一起,沉迷于被禁止的“情侣聚会之旅”--
因突变而产生操作火焰的变种人“燃烧者”,让半个世界被大火烧成焦土,陷入前所未见的惨状。在那之后的30年,当中一群激进份子“疯狂燃烧者”再次对世界发动攻击。