《时代飞船》系列作品改编自去年播出的《时代飞船24》的世界观，以三个反派为主角。三大反派是指本作中的三个反派，他们通常伪装成世界上最大的教科书出版商“天国社会史”第14期仓库课程的成员。
新宿区东侧……极尽混沌的街区中心，是霓虹闪烁的歌舞伎町。光线愈强则暗影愈浓，在恶人潜伏着的黑暗更深处，侦探长屋的灯光长明。哈德森夫人所经营的这间长屋，聚集着各种古怪之人。
这一天，柏木空收到了父亲从埃及寄来的包裹，打开包裹后，一个小小的木乃伊出现在了柏木空的面前，看着这个瑟瑟发抖的迷之生物，柏木空哭笑不得。 就这样，柏木空开始了和木乃伊一起的生活，肩负起了照顾小木乃伊的职责。之后，更多奇形怪状的生物出现在柏木空的身边——个性暴躁贪吃又懒惰的可尼、成熟稳重智商超群的阿勇。
