永恒的“6:59”开始了——在友和家族中,有一种传统,即使用代代相传的“停止境界”技术,让人进入一切停止的“停止领域”。一天,主人公在树上的侄子和兄弟被绑匪绑架了。
Yuki Shinji(水濑树配音)是一名就读于多多良喜高中二年级的女孩。她生性活泼外向,很容易对新事物感到好奇。然而,她谨慎和胆小的天性往往使她浅薄,无法深入研究这些事情。
謎の奇病、「キマイラ」に体を蝕まれる大企業の会長、クロスワード。彼は小さな島に屋敷を建てて住んでいた。彼の病気は発作を起こせばたちまち極度の脱水症状へと陥り、大量の水を欲するものの飲めば体の至る所からそれをすべて出してしまうといった恐ろしい奇病である。最終的には口から青い光を出して死に至る。ブラックジャックを呼び寄せ、治療を行うものの原因は全くつかめず。島にいた唯一の診療医も兄がその病に冒され、やがて死に至った。島の人間達は、次第にキマイラが大量発生したのはやつのせいだと、クロスワードに対する不信感を表し、各々が武器を片手に屋敷へと歩き出すのであった……。