与此同时，来自国外的红发学生明日香（宫村洋子配音）和玲博丽（林惠美配音）一分为二，以姐妹身份出现，给Ikari真嗣的学校生活带来了巨大的变化。此外，原作中高大帅气的原型也将以娇小可爱的形象作为学院的一部分出现在动画中。该动画以《新世界福音战士》中的人物为原型，取代了原作沉重严肃的氛围，描绘了轻松愉快的校园生活。制作团队首次采用3D Q版设计，搭配逼真的背景和2D拼接，创造出多样化的绘画风格。
曾经心甘情愿堕落的爱子（宫崎葵饰演）被父亲（渡边贤一饰演）带回海边小镇，遇到了沉默寡言的佐贺（松山贤一饰演的）。在东京工作的Gay Yoma（由他的妻子和丈夫Tomoto饰演）把温柔的Naoto（由Ayano Gang饰演）带回家。他不信任对方，但他试着再次相信他们。小泉（Hirose Rin饰演）随母亲搬到了冲绳，跟随他的同学辰仔（Sakumato Moto饰演）来到了一个荒岛。在废墟中，他遇到了背包客田中（森山智美饰演），他们成为了短暂的朋友。突然，一个可怕的命运降临在小泉的身上。不久之后，通缉名单在全国各地传播开来，人们对这三名男子的真实身份产生了怀疑。。。本片改编自吉田秀吉的同名原作。
