剧情紧接外传 Battlefield of Pacifist(和平主义者的战场),地球与殖民地的战斗于殖民后196年结束。除五飞外,希罗等四位高达驾驶员决心把高达送往太阳丢弃,然而统一的地球圈再次被人类的欲望所吞噬,战乱再一次燃起。
故事主要讲述了就读于圣克罗尼亚学园高中部的溷血儿羽濑川小鹰,在某一天看到了美少女三日月夜空一个人愉悦地说着话,之后两人便开始聊起关于如何交朋友的话题。而没想到夜空建立了一个以交朋友为目的问题社团──邻人部,各种问题美少女先后申请入社。
在这项工作的舞台上,一个被称为“西欧财阀”的庞大组织利用财政和军事资源在全球范围内进行彻底的资源管理,导致技术和人类进步停滞不前。因此,从表面上看,自2000年代以来,技术一直没有改变。