小智(松本梨花 配音)带着皮卡丘(大谷育江 配音),和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上,一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴(钉宫理惠 配音)的少女麦亚丽(中川翔子 配音)。胡巴能够制造出神奇的时空圆环,带领大家在不同的地点来回穿梭。一股平静的风吹过美丽的阿斯特拉大地。在大陆的一个角落里,失去记忆的男孩有树醒来了。他由他的小向导可可·洛、总是饥肠辘辘的美少女剑客佩科拉姆和略显冷漠的猫耳朵魔法少女凯露照顾。在命运的指引下,他们成立了一个名为“食堂”的行会。