大浩真人(石黑春贵配音)是一名非常普通的男高中生。和大多数同龄男孩一样,真人对游戏和勇者斗龙的古老传说很感兴趣。唯一让真人感到困扰的是,他有一个过度保护和关心他的母亲真子(由茂叶爱一配音)。
季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。