季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
2071年,随着超光速导航技术的实施,人类能够在太阳系内方便地移动。然而,由于设计错误,这项技术在月球上引发了爆炸,吸引了无数月球碎片飞向地球,造成了前所未有的灾难。幸存的人类逃离地球,开始在整个太阳系建立家园。
1918年,松浦与丈夫和三个孩子一起住在富山县海岸的渔村。村里的男人纷纷离家捕鱼,妻子们则留守家中,每天都要消耗大量大米养家糊口。松浦每日的工作是将一袋袋大米拖到岸边。随着日本出兵西伯利亚,米价开始飞涨。