Wille指示Akira（由Yuko Miyamura配音）和Shinri（由Masayama Sakamoto配音）夺回被封在卫星轨道上的Choku飞船和Hina Shinji（由Keimei Ogata配音），但Shinji被绝对禁止登上Choku飞船。无知的真嗣感受到了周围的敌意，跟随Ayanami（由Hyumi Lin配音）登上了突然入侵的9号航班，回到了千疮百孔的NERV总部。在这里，他意外地与朝思叶心目中的Ayanami重聚。他还从父亲那里得知，他将与漂亮的年轻人石田正久一起驾驶第13架飞机。时隔14年，其间的沧桑和情感纠葛让真嗣不知所措。看似温和的长崎为他揭示了各种不可思议的真相。。。这部电影是长荣新剧场版三部曲的第三部。
50年前，打算成为真正怪物的犬夜叉为了获得四魂玉，遇到了强大的精神女巫桔梗。在一起呆了一段时间后，两人发展了关系。犬夜叉因此希望成为人类，桔梗也计划在净化四魂玉后回归普通生活。然而，对桔梗怀有邪恶想法的偷蜘蛛将自己的灵魂和身体交给了怪物，然后转世成为邪恶的半恶魔奈良。在他的唆使下，犬夜叉被桔梗封印在神木上，身受重伤的桔梗也在悲伤和绝望中死去。桔梗转世的卡格救了犬夜叉，但不小心把四魂玉射成了碎片。为了取回碎片，她和她的同伴，包括七宝、弥勒、珊瑚，以及犬夜叉一起踏上了一段充满困难和障碍的旅程
伊丽莎白（金·贝辛格饰演）在一家美术馆工作。她最近与前夫离婚，至今仍被前夫纠缠，对爱情既感到恐惧又充满希望。华尔街特工约翰（米基·洛克饰演）的热情追求让伊丽莎白胆小如鼠，但又充满了新鲜的兴奋。
