《战国BASARA》中活跃的武将们,在现代高中再次展开了激烈的战斗:前任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处分,学园内群雄割据,为争夺新会长之位成为乱世。电影版的舞台是在梅志夫离开该部门两年后。被调到冈山县濑户的美池夫开始为这位历史上最年轻的防卫大臣的受伤负责。在调查事件背景——“宙斯盾”舰相撞事件期间,由于航行内容属于国家机密,“传宗刀”的“授权发射”无法使用。