故事从一个名叫“濑户一木”的普通高中男孩的角度展开，他崇拜校园女神“植木一树”。暗恋伊子的一木，脑子里总是有各种妄想，但表面上对伊子很冷漠。在一次机会下，两人终于消除了误会，两人之间的距离逐渐拉近
故事发生在从10年前发生了的“同时多发无气力症”的灾难中恢复的未来型新兴城市"绫风市"。相隔10年之久，高中生神乡慎与弟弟洵在绫风市遇到了担任绫风市警察署长的哥哥谅。 而这个时候，在绫风市正发生了各种各样的怪异事件。
在世界的角落里，有着这样一种生物：它们下等且奇怪，不同于任何动植物，有自己的生命形态以及生存方式。自古以来为人类所敬畏，不知何时开始，被称为“虫”。“虫师”这个职业便应运而生，他们对虫进行研究，并接受人们的委托，解决由虫引起的奇异事件。
